След инсталирането на XGL  установих, че OpenGL  ла нещо не върви.
Ето линк за решение на проблема.
http://ubuntuforums.org/showthread.php?t=176636
Решението съм го тествал само под Убунту 6.06.1!!
Доколкото ми е известно работи само с видео картите на Ен Видия!

Така след като изпълните указанията просто стартирайте всяко приложение което иска Опен Джи Ел /или оверлей-например ти ви тунери или програма за кепчване от Ди Ви Ай камера/ с командата nonXgl името на програмата.